เทศบาลตำบลเพชรพะงัน ได้ดำเนินการสำรวจสภาพปัญหาน้ำเสียในพื้นที่ ประจำปีงบประมาณ ๒๕๖๘ พบว่า น้ำที่ผ่านการนำไปใช้ประโยชน์ในกิจกรรมต่างๆ เช่น ครัวเรือน การประกอบกิจการยังไม่พบปัญหาน้ำเสียเกิดขึ้นในพื้นที่ โดยได้บันทึกข้อมูลที่เก็บจากแหล่งกำเนิดมลพิษ และมีการรายงานคุณภาพน้ำทิ้งจากโรงพยาบาลเกาะพะงันเป็นประจำทุกเดือน